Исследование сегментов гетерозиготности в геномах российских пород овец
https://doi.org/10.26897/2074-0840-2025-4-12-14
Аннотация
В статье приводятся результаты идентификации участков с повышенной гетерозиготностью в геномах овец карачаевской и романовской пород на основании данных полногеномного секвенирования. Выявлены особенности наличия и распространения гетерозиготных сегментов в породах, в том числе на уровне хромосом. Различия в распределении участков гетерозиготности в геномах разных пород указывают на возможное участие генов в этих регионах в процессе отбора, влияющего на формирование хозяйственно-значимых признаков.
Об авторах
А. С. Абдельманова
ФГБНУ «Федеральный исследовательский центр животноводства – ВИЖ им. академика Л.К. Эрнста
Россия
Россия
Александра Сергеевна Абдельманова, ст. науч. сотрудник, доктор биол. наук
142132, Московская обл., Подольский р-н, пос. Дубровицы, 60
Т. Е. Денискова
ФГБНУ «Федеральный исследовательский центр животноводства – ВИЖ им. академика Л.К. Эрнста
Россия
Россия
Татьяна Евгеньевна Денискова, вед. науч. сотрудник, канд. биол. наук
142132, Московская обл., Подольский р-н, пос. Дубровицы, 60
М. С. Форнара
ФГБНУ «Федеральный исследовательский центр животноводства – ВИЖ им. академика Л.К. Эрнста
Россия
Россия
Маргарет Сержевна Форнара, ст. науч. сотрудник, канд. биол. наук
142132, Московская обл., Подольский р-н, пос. Дубровицы, 60
Список литературы
1. Liu S.Q., Xu Y.J., Chen Z.T., Li H., Zhang Z., Wang Q.S., Pan Y.C. Genome-wide detection of runs of homozygosity and heterozygosity in Tunchang pigs ● Animal, 2024. Vol.18 (8). Р. 101236. doi: 10.1016/j.animal.2024.101236.
2. Li G., Tang J., Huang J., Jiang Y., Fan Y., Wang X., Ren J. Genome-wide estimates of runs of homozygosity, heterozygosity, and genetic load in two Chinese indigenous goat breeds ● Front Genet., 2022. Vol. 13. Р. 774196. doi: 10.3389/fgene.2022.774196.
3. Ferrer E.S., García-Navas V., Sanz J.J., Ortego J. The strength of the association between heterozygosity and probability of interannual local recruitment increases with environmental harshness in blue tits ● Ecology and Evolution, 2016. Vol. 6. Рp. 8857-8869. doi: 10.1002/ece3.2591.
4. dos Santos W.B., Schettini G.P., Fonseca M.G., Pereira G.L., Chardulo L.A.L., Machado Neto O.R., Baldassini W.A., de Oliveira H.N., Curi R.A. Fine-scale estimation of inbreeding rates, runs of homozygosity and genome-wide heterozygosity levels in the Mangalarga Marchador horse breed ● J Anim. Breed Genet., 2021. Vol. 138. Рp. 161-173. doi: 10.1111/jbg.12508.
5. Williams J.L., Hall S.J.G., Del Corvo M., Ballingall K.T., Colli L., Ajmone Marsan P., Biscarini F. Inbreeding and purging at the genomic Level: the Chillingham cattle reveal extensive, non-random SNP heterozygosity ● Anim. Genet., 2016. Vol. 47. Рp. 19-27. doi: 10.1111/age.12376.
6. Mulim H.A., Brito L.F., Pinto L.F.B., Ferraz J.B.S., Grigoletto L., Silva M.R., Pedrosa V.B. Characterization of runs of homozygosity, heterozygosity-enriched regions, and population structure in cattle populations selected for different breeding goals ● BMC Genomics, 2022. Vol. 23 (1). Рp. 209. doi: 10.1186/s12864-022-08384-0.
7. Samuels D.C., Wang J., Ye F., He J., Levinson R.T., Sheng Q., Zhao S., Capra J.A., Shyr Y., Zheng W., Guo Y. Heterozygosity ratio, a robust global genomic measure of autozygosity and its association with height and disease risk ● Genetics, 2016. Vol. 204 (3). Рp. 893-904, doi: 10.1534/genetics.116.189936.
8. Chen Z., Zhang Z., Wang Z., Zhang Z., Wang Q., Pan Y. Heterozygosity and homozygosity regions affect reproductive success and the loss of reproduction: A case study with litter traits in pigs ● Comput Struct Biotechnol J., 2022. Vol. 20. Рp. 4060-4071. doi: 10.1016/j.csbj.2022.07.039.
9. Selli A., Ventura R.V., Fonseca P.A.S., Buzanskas M.E., Andrietta L.T., Balieiro J.C.C., Brito L.F. Detection and visualization of heterozygosity-rich regions and runs of homozygosity in worldwide sheep populations ● Animals, 2021. Vol. 11. Р. 2696. doi: 10.3390/ani11092696.
Рецензия
Для цитирования:
Абдельманова А.С., Денискова Т.Е., Форнара М.С. Исследование сегментов гетерозиготности в геномах российских пород овец. Овцы, козы, шерстяное дело. 2025;(4):12-14. https://doi.org/10.26897/2074-0840-2025-4-12-14
For citation:
Abdelmanova A.S., Deniskova T.E., Fornara M.S. Study of heterozygosity segments in the genomes of Russian sheep breeds. Sheep, goats, wool business. 2025;(4):12-14. (In Russ.) https://doi.org/10.26897/2074-0840-2025-4-12-14
Просмотров:
44
JATS XML
Послать статью по эл. почте 