Разработка и апробация тест-системы для секвенирования фрагмента гена PRNP домашних коз

В статье представлены этапы разработки универсальной тест-системы, направленной на установление генотипа в кодонах целевого фрагмента 3 экзона гена прионового протеина (PRNP) у домашних коз (Capra hircus). Проведена апробация тест-системы. Выявлено наличие полиморфизма в целевом фрагменте 3 экзона гена PRNP у домашних коз. У 20 исследуемых образцов коз были выявлены различные аллельные варианты в кодонах 37, 40, 122, 142, 143, 146, 154, 211, 222, 240 и 244, соответственно. Разработанная тест-система позволит оценить уровень полиморфизма в целевом фрагменте гена PRNP у домашних коз различных пород, разводимых на территории Российской Федерации.

1. Зуев В.А., Кальнов С.Л., Куликова Н.Ю., Гребенникова Т.В. Современное состояние проблемы прионных болезней и причины их опасности для человека и животных • Вопросы вирусологии, 2020. № 65 (2). С. 71-76. DOI: 10.36233/0507-4088-2020-65-2-71-76.

2. Acm C., Bolea R., Monzon M. [et al.] Classical and Atypical Scrapie in Sheep and Goats. Review on the Etiology, Genetic Factors, Pathogenesis, Diagnosis, and Control Measures of Both Diseases • Animals (Basel), 2021. No.11 (3). Pp. 691. DOI: 10.3390/ani11030691.

3. Hunter N. PrP genetics in sheep and the application for scrapie and BSE • Trends Microbiol, 1997. No. 5. Pp. 331=334. DOI: 10.1016/S0966-842X(97)01081-0.

4. Денискова Т.Е., Костюнина О.В., Селионова М.И. [и др.]. Мониторинг генетической резистентности 14 российских пород овец к скрепи • Овцы, козы, шерстяное дело, 2019. № 1. С. 15-17.

5. Ricci A., Allende A. [et al.]. EFSA Panel on Biological Hazards (BIOHAZ). Genetic resistance to transmissible spon-giform encephalopathies (TSE) in goats • EFSA J., 2017. No. 15 (8). Pp. e04962. DOI: 10.2903/j.efsa.2017.4962.

6. Goldmann W., Ryan K., Foster J. [et al.]. Caprine prion gene polymorphisms are associated with decreased incidence of classical scrapie in goat herds in the United Kingdom • Vet. Res, 2011. No. 42. Pp. 110. DOI: 10.1186/1297-9716-42-110.

7. Dassanayake R.P., White S.N., Madsen-Bouterse S.A. [et al.]. Role of the PRNP S127 allele in experimental infection of goats with classical caprine scrapie • Anim. Genet., 2015. No. 46. Pp. 341. DOI: 10.1111/age.12291.

8. Vouraki S., Gelasakis A.I., Alexandri P. [et al.]. Genetic profile of scrapie codons 146, 211 and 222 in the PRNP gene locus in three breeds of dairy goats • PLoS One., 2018. No. 13 (6). P e0198819. DOI: 10.1371/journal.pone.0198819.

9. Fantazi K., Migliore S., Kdidi S. [et al.]. Analysis ofdifferences in prion protein gene (PRNP) polymorphisms between Algerian and Southern Italy's goats • Ital. J. Anim. Sci., 2018. No. 17. Pp. 578-585. DOI: 10.1080/1828051X.2017.1420430.

10. Kim S.K., Kim Y.C., Won S.Y., Jeong B.H. Potential scrapie-associated polymorphisms of the prion protein gene (PRNP) in Korean native black goats • Sci Rep, 2019. No. 9 (1). Pp. 15293. DOI: 10.1038/s41598-019-51621-y.

11. Adeola A.C., Bello S.F., Abdussamad A.M. [et al.]. Scrapie-associated polymorphisms of the prion protein gene (PRNP) in Nigerian native goats • Gene., 2023. No.855. Pp. 147121. DOI: 10.1016/j.gene.2022.147121.