Филогенетический анализ полных последовательностей митохондриального генома овец куйбышевской породы
https://doi.org/10.26897/2074-0840-2022-4-8-11
Аннотация
статье представлены результаты филогенетического анализа овец куйбышевской породы. Впервые получены и проанализированы в аспекте отдельных маркеров полные последовательности митохондриального генома российской породы овец. Установлен уровень полиморфизма в отдельных митохондриальных маркерах. Рассчитаны показатели генетического разнообразия как для отдельных генов, так и для полного митохондриального генома. На основании провденного анализа построено филогенетическое дерево, а также определена гаплогрупповая принадлежность изучаемых овец. Регулярное проведение подобных работ поспособствует накоплению знаний о полиморфизмах всех митохондриальных маркеров. Полученные знания позволят углубить понимание роли митохондриальной ДНК в жизнедеятельности овец.
Об авторах
О. А. Кошкина
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр животно водства – ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста»
Россия
Россия
Кошкина Ольга Андреевна, аспирант, мл. науч. сотрудник группы генетики и геномики мелкого рогатого скота
тел.: (926) 532-21-19
Т. Е. Денискова
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр животно водства – ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста»
Россия
Россия
Денискова Татьяна Евгеньевна, канд. биол. наук, доцент, вед. науч. сотрудник группы генетики и геномики мелкого рогатого скота
тел.: (916) 914-20-17
Н. А. Зиновьева
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр животно водства – ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста»
Россия
Россия
Зиновьева Наталия Анатольевна, доктор биол. наук, профессор, академик РАН, директор
тел.: (4967) 65-11-63
Список литературы
1. Пушкарев М.Г. Состояние породного овцеводства и козоводства России // Научные разработки и инновации в решении стратегических задач агропромышленного комплекса: Материалы Международной научно-практ. конференции. В 2-х томах, Ижевск, 15-18 февраля 2022 года. – Ижевск: Ижевская государственная сельскохозяйственная академия, 2022. – С. 85-87.
2. Лушников В.П. Полиморфизм гена CAST у овец татарстанской и эдильбаевской пород / В.П. Лушников, Т.О. Фетисова, А.А. Стрильчук // Овцы, козы, шерстяное дело. – 2020. – № 2. – С. 9-11.
3. Abecia J.A. Ewes giving birth to female lambs produce more milk than ewes giving birth to male lambs / J.A. Abecia, C. Palacios // Italian Journal of Animal Science. 2018; 17(3):736-739. doi: 10.1080/1828051X.2017. 1415705.
4. Golik T.V. Spectra of ISSR-PCR Markers in Assessments of the Intrinsic Genetic Diff erentiation of the Karachai Horse / T.V. Golik, I.I. Gaponova, E.A. Knyaseva, T.A. Erkenov, T.T. Glazko. // Biogeosystem Technique. 2017; 4 (1): 9-24. DOI: 10.13187/bgt.2017.1.9.
5. Glazko V.I. Genetic Structure of Karachai Horses on ISSR-PCR Markers / V.I. Glazko, T.A. Erkenov, T.T. Glazko, K.M. Dzatoev // Biogeosystem Technique. 2016; 9(3):195-204. DOI: 10.13187/bgt.2016.9.195.
6. Денискова Т.Е. Оценка биоразнообразия у межвидовых гибридов рода Ovis с использованием STR- и SNP-маркеров / Т.Е. Денискова, А.В. Доцев, В.А. Багиров [и др.] // Сельскохозяйственная биология. – 2017. – № 52 (2). – С. 251-260. – DOI 10.15389/agrobiology.2017.2.251rus.
7. Meadows J.R. Five ovine mitochondrial lineages identifi ed from sheep breeds of the near East / J.R. Meadows, I. Cemal, O. Karaca, E. Gootwine, J.W. Kijas // Genetics. 2007; 175(3): 1371-1379 doi: 10.1534/ge-netics.106.068353.
8. Кошкина О.А. Оценка материнской изменчивости российских локальных пород овец на основе анализа полиморфизма гена цитохрома b / О.А. Кошкина, Т.Е. Денискова, А.В. Доцев [и др.] // Сельскохозяйственная биология. – 2021. – № 56 (6). – С. 1134-1147. – DOI 10.15389/agrobiology.2021.6.1134rus.
9. Barbato M. Islands as time capsules for genetic diversity conservation: the case of the giglio island moufl on / M. Barbato, M. Masseti, M. Pirastru, N. Columbano, M. Scali, R. Vignani, P. Mereu, // Diversity. 2022; 14(8): 609.
10. Liu J. Phylogeography and phylogenetic evolution in Tibetan sheep based on MT-CYB sequences / J. Liu, Z. Lu, C. Yuan, F. Wang, B. Yang // Animals. 2020; 10(7): 117 (doi: 10.3390/ani10071177).
11. Yu L. Mitogenomic analysis of Chinese snub-nosed monkeys: Evidence of positive selection in NADH dehydrogenase genes in highaltitude adaptation / L. Yu, X. Wang, N. Ting, Y. Zhang // Mitochondrion. 2011; 11(3): 497-503. https://doi.org/10.1186/s12862-017-0896-0.
Рецензия
Для цитирования:
Кошкина О.А., Денискова Т.Е., Зиновьева Н.А. Филогенетический анализ полных последовательностей митохондриального генома овец куйбышевской породы. Овцы, козы, шерстяное дело. 2022;(4):8-11. https://doi.org/10.26897/2074-0840-2022-4-8-11
For citation:
Koshkina O.A., Deniskova T.E., Zinovieva N.A. Phylogenetic analysis of complete mitochondrial genomes of sheep of the Kuibyshev breed. Sheep, goats, wool business. 2022;(4):8-11. (In Russ.) https://doi.org/10.26897/2074-0840-2022-4-8-11
Просмотров:
29
Послать статью по эл. почте 