Популяционно-генетическая характеристика некоторых пород коз на основе анализа микросателлитов
Аннотация
В статье дана характеристика популяционно-генетической структуры и степени генетической дифференциации советской шерстной, таджикской шерстной, оренбургской пуховой, альпийской и зааненской молочных пород коз, с использованием анализа микросаетллитов.
Ключевые слова
коза,
порода,
генетическое разнообразие,
микросателлиты,
goat,
breed,
genetic diversity,
microsatellites
Об авторах
Вероника Руслановна Харзинова
ФГБНУ «Федеральный научный центр животноводства - ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста»
Россия
Россия
Сергей Николаевич Петров
ФГБНУ «Федеральный научный центр животноводства - ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста»
Россия
Россия
Арсен Владимирович Доцев
ФГБНУ «Федеральный научный центр животноводства - ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста»
Россия
Россия
Наталья Александровна Безбородова
ФГБНУ «Уральский федеральный аграрный научно-исследовательский центр Уральского отделения Российской академии наук»
Россия
Россия
Наталия Анатольевна Зиновьева
ФГБНУ «Федеральный научный центр животноводства - ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста»
Россия
Россия
Список литературы
1. Ревякин Е.Л. Рекомендации по развитию козоводства / Е.Л. Ревякин Л.Т. Мехрадзе С.И. Новопашина. -М.: ФГНУ «Росинформагротех». - 2010. - 120 с.
2. http://agrarnik.ru/news/molochnoe-kozovodstvo-per-spektivnaja-otrasl6-sel6skogo-hozjajstva-v-rossii~6188/) Дата обращения: 04.04. 2019.
3. http://farm.dp.ua/ Дата обращения: 04.04. 2019.
4. Сафаров Т. С. Хозяйственные и биологические особенности местных коз Таджикистана: дисс. канд. с-х. наук. - Таджикистан. - 2017. - 177 с.
5. Косимов Ф.Ф. Таджикская шерстная порода коз // Зоотехния. - 2015. - № 3. - С. 5-7.
6. Буканов А.Л. Рост, развитие и реализация продуктивного потенциала молодняка коз оренбургской породы в зависимости от пола и физиологического состояния: дисс. канд. с-х. наук. - Оренбург. - 2008. - 163 с.
7. Сефербекова С.М. Сравнительная характеристика коз зааненской и русской белой породы / С.М. Сефербекова А.А. Коростина Д.М. Мусин Е.В. Шацких // Молодежь и наука. - 2016. - № 12. - С. 3-9.
8. https://studref.com/579174/agropromyshlennost/porody Дата обращения: 06.04. 2019.
9. Брюнчугин В.В. Продуктивность и технологические свойства молока коз зааненской, альпийской и нубийской пород: дисс. канд. с-х. наук. - Москва. - 2012. -182 с.
10. Barker T. Genetic variation within and relationships among populations of Asian goats (Capra hircus) / T. Barker M. Moore S. Matheson // J. Anim. Breed. Genet. - 2001. -№ 118.-P 213-233(doi.org/10.1046/j.1439-0388.2001.00296.x.).
11. Харзинова В.Р. Изучение аллелофонда и степени генетической интрогрессии домашней и дикой популяций северного оленя (Rangifer tarandus L., 1758) с использованием микросателлитов / В.Р. Харзинова А.В. Доцев А.С. Крамаренко К.А. Лайшев Т.М. Романенко А.Д. Соловьева Т.Е. Денискова О.В. Костюнина Г. Брем Н.А. Зиновьева // Сельскохозяйственная биология. - 2016. - № 51. - С. 811-823. (doi: 10.15389/ agrobiology.2016.6.811rus).
12. Kim K.S. Genetic diversity of goats from Korea and China using microsatellite analysis / K.S. Kim J.S. Ye o J.W. Lee J.W. Kim C.B. Choi // Asian-Australasian Journal of Animal Sciences. - 2002. - № 15(4). - С. 461-465. (doi: https://doi.org/10.5713/ajas.2002.461).
13. Asroush F. Genetic characterization of Markhoz goat breed using microsatellite markers / F. Asroush, S-Z. Mirhoseini N. Badbarin A. Seidavi V. Tufarelli V. Laudadio C. Dario M. Maria Selvaggi //Arch.Anim. Breed. - 2018. -№ 61. - P. 469-473. (doi.org/10.5194/aab-61-469-2018).
14. Lenstra J.A. Microsatellite diversity of the Nordic type of goats in relation to breed conservation: how relevant is pure ancestry? / J.A. Lenstra J. Tigchelaar I. Biebach, Econogene Consortiuma J.H. Hallsson J. Kantanen V.H. Nielsen F. Pompanon S. Naderi H.-R. Rezaei N. Ssther O. Ertugrul C. Grossen G. Camenisch M. Vos-Loohuis M. van Straten E.A. de Poel J. Windig K.J. Oldenbroek // Anim. Breed. Genet. - 2017. - № 134. - P. 78-84. (doi:10.1111/jbg.12226).
15. Петров С.Н. Разработка мультиплексной STR-панели для контроля достоверности происхождения и характеристики генетического разнообразия коз. / С.Н. Петров В.Р. Харзинова Е.А. Гладырь Ч.С. Самбу-Хоо Н.А. Зиновьева // Достижения науки и техники АПК. - 2018. - № 32, 11. - С. 60-63.
16. Peakall R. GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research - an update. / R. Peakall P.E. Smouse // Bioinformatics - 2012. -№ 28. - P. 2537-2539. (doi: 10.1093/bioinformatics/bts460).
17. Brown A.H.D. Measuring genetic variability in plant populations. In: Isozymes in plant genetics and breeding, Part A. / A.H.D. Brown B.S. Weir S.D. Tanksley T.J. Orton (eds.) // Amsterdam. - Elsevier Science Publ. - 1983.
18. Kalinowski S.T. Counting alleles with rarefaction: Private alleles and hierarchical sampling designs // Conserv. Genet. - 2004. - № 5. - P. 539-543. (doi: 10.1023/B: C0GE.0000041021.91777.1a).
19. Hartl D.L. Principles of population genetics / D.L. Hartl A.G. Clark // Massachusetts. - Sunderland. - 1997.
20. Keenan K. diveRsity: An R package for the estimation and exploration of population genetics parameters and their associated errors / K. Keenan P. McGinnity T.F. Cross W.W. Crozier P.A. Prodohl // Methods in Ecology and Evolution. - 2013. -№ 4. - P. 782-788. (doi.org/10.1111/2041-210X.12067).
21. Jost L. GST and its relatives do not measure differentiation // Mol. Ecol. - 2008. - № 17. - P. 4015-4026. (doi: 10.1111/j.1365-294X.2008.03887.x).
22. Nei M. Genetic distance between populations // Am. Nat. - 1972. - № 106 (949). - P. 283-292. (doi: 10.1086/282771).
23. Huson D.H. Application of phylogenetic networks in evolutionary studies / D.H. Huson D. Bryant // Molecular Biology and Evolution. - 2006. - № 23. - P. 254-267. (doi. org/10.1093/molbev/msj030).
24. Jombart T. adegenet: a R package for the multivariate analysis of genetic markers // Bioinformatics. - 2008. -№ 24. - P. 1403-1405. (doi: 10.1093/bioinformatics/btn129).
25. Wickham H. ggplot2: Elegant graphics for data analysis // NY - Springer-Verlag. - 2009.
26. R Core Team. R: a language and environment for statistical computing. R Foundation for statistical computing. Vienna. - Austria. - 2012. http://www.Rproject.org.
27. Seilsuth S. Microsatellite analysis of the genetic diversity and population structure in dairy goats in Thailand / S. Seilsuth J.H. Seo H.S. Kong G.J. Jeon // Asian-Australis J Anim Sci. - 2016. - № 29(3). - P. 327-332. (doi: 10.5713/ajas.15.0270).
28. Mahrous K.F. Genetic diversity in Egyptian and Saudi goat breeds using microsatellite markers / K.F. Mahrous S.Y.M. Alakilli L.M. Salem S.H. Abd El-Aziem A.A. El Hanafy // Journal of applied biosciences. - 2013. -№ 72. - P. 5838-5845. (doi: 10.4314/jab.v72i1.99671).
29. Patterson N. Population Structure and Eigenanalysis / N. Patterson A.L. Price D. Reich // PLoS Genet. - 2006. -№ 2(12). - e190. (doi.org/10.1371/journal.pgen.0020190).
30. Novembre J. Genes mirror geography within Europe / J. Novembre T. Johnson K. Biyc Z. Kutalik A.R. Boyko // Nature. - 2008. - № 456. - P. 98-101.
31. Храброва Л.А. Методические положения по использованию ДНК-анализа лошадей для оценки генетических ресурсов в коневодстве / Л.А. Храброва Л.В. Калинкова М.А. Зайцева. - Дивово. - 2011. - 28 c.
32. Maletsanake D. Genetic variation from 12 microsatellite makers in an indigenous Tswana goat flock in Southeastern Botswana / D. Maletsanake S.J. Nsoso P.M. Kgwatalala // Livestock research for rural development. - 2013. - № 25 (2).
33. Davila S.G. Evaluation of diversity between different Spanish chicken breeds, a tester line and White Leghorn population based on microsatellite markers / S.G. Davila M.G. Resino-Talavan J.L. Campo // Poult.Sci. - 2009. -№ 88. - P. 2518-2525. (doi: 10.3382/ps.2009-00347).
34. Doiji N. Genetic characterization of Bhutanese native chickens based on an analysis of Red Junglefowl (Gallus gallusgallus and Gallus gallusspadecieus), domestic Southeast Asian and commercial chicken lines (Gallus gallusdomesticus) / N. Dorji M. Duangjinda Y. Phasuk // Genetics and Molecular Biology. - 2012. - № 35. - P. 603-609 (doi: 10.1590/ S1415-47572012005000039).
35. Mahmoudi B. Breed characteristics in Iranian native goat populations / B. Mahmoudi M. Babayev Sh. Hayeri Khiavi F. Pourhosein M. Daliri // Journal of cell and animal biology. - 2011. - № 5(7). - P. 129-134.
36. Mekuriaw G. Review on current knowledge of genetic diversity of domestic goats (Capra hircus) identified by microsatellite loci: how those efforts are strong to support the breeding programs? / G. Mekuriaw S. Gizaw T. Dessie O. Mwai A. Djikeng K. A Tesfaye // Journal of Life Science and Biomedicine. - 2016. - № 6(2). - P. 22-32.
Рецензия
Для цитирования:
Харзинова В.Р., Петров С.Н., Доцев А.В., Безбородова Н.А., Зиновьева Н.А. Популяционно-генетическая характеристика некоторых пород коз на основе анализа микросателлитов. Овцы, козы, шерстяное дело. 2019;(3):7-11.
Просмотров:
114
Послать статью по эл. почте 