Популяционно-генетическая характеристика некоторых пород коз на основе анализа микросателлитов
Abstract
The article describes the population-genetic structure and degree of genetic differentiation of the Soviet wool, Tajik wool, Orenburg downy, Alpine and Zaanen dairy breeds of goats, using the microsatellites analysis.
Keywords
коза,
порода,
генетическое разнообразие,
микросателлиты,
goat,
breed,
genetic diversity,
microsatellites
About the Authors
Вероника Харзинова
ФГБНУ «Федеральный научный центр животноводства - ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста»
Russian Federation
Russian Federation
Сергей Петров
ФГБНУ «Федеральный научный центр животноводства - ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста»
Russian Federation
Russian Federation
Арсен Доцев
ФГБНУ «Федеральный научный центр животноводства - ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста»
Russian Federation
Russian Federation
Наталья Безбородова
ФГБНУ «Уральский федеральный аграрный научно-исследовательский центр Уральского отделения Российской академии наук»
Russian Federation
Russian Federation
Наталия Зиновьева
ФГБНУ «Федеральный научный центр животноводства - ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста»
Russian Federation
Russian Federation
References
1. Ревякин Е.Л. Рекомендации по развитию козоводства / Е.Л. Ревякин Л.Т. Мехрадзе С.И. Новопашина. -М.: ФГНУ «Росинформагротех». - 2010. - 120 с.
2. http://agrarnik.ru/news/molochnoe-kozovodstvo-per-spektivnaja-otrasl6-sel6skogo-hozjajstva-v-rossii~6188/) Дата обращения: 04.04. 2019.
3. http://farm.dp.ua/ Дата обращения: 04.04. 2019.
4. Сафаров Т. С. Хозяйственные и биологические особенности местных коз Таджикистана: дисс. канд. с-х. наук. - Таджикистан. - 2017. - 177 с.
5. Косимов Ф.Ф. Таджикская шерстная порода коз // Зоотехния. - 2015. - № 3. - С. 5-7.
6. Буканов А.Л. Рост, развитие и реализация продуктивного потенциала молодняка коз оренбургской породы в зависимости от пола и физиологического состояния: дисс. канд. с-х. наук. - Оренбург. - 2008. - 163 с.
7. Сефербекова С.М. Сравнительная характеристика коз зааненской и русской белой породы / С.М. Сефербекова А.А. Коростина Д.М. Мусин Е.В. Шацких // Молодежь и наука. - 2016. - № 12. - С. 3-9.
8. https://studref.com/579174/agropromyshlennost/porody Дата обращения: 06.04. 2019.
9. Брюнчугин В.В. Продуктивность и технологические свойства молока коз зааненской, альпийской и нубийской пород: дисс. канд. с-х. наук. - Москва. - 2012. -182 с.
10. Barker T. Genetic variation within and relationships among populations of Asian goats (Capra hircus) / T. Barker M. Moore S. Matheson // J. Anim. Breed. Genet. - 2001. -№ 118.-P 213-233(doi.org/10.1046/j.1439-0388.2001.00296.x.).
11. Харзинова В.Р. Изучение аллелофонда и степени генетической интрогрессии домашней и дикой популяций северного оленя (Rangifer tarandus L., 1758) с использованием микросателлитов / В.Р. Харзинова А.В. Доцев А.С. Крамаренко К.А. Лайшев Т.М. Романенко А.Д. Соловьева Т.Е. Денискова О.В. Костюнина Г. Брем Н.А. Зиновьева // Сельскохозяйственная биология. - 2016. - № 51. - С. 811-823. (doi: 10.15389/ agrobiology.2016.6.811rus).
12. Kim K.S. Genetic diversity of goats from Korea and China using microsatellite analysis / K.S. Kim J.S. Ye o J.W. Lee J.W. Kim C.B. Choi // Asian-Australasian Journal of Animal Sciences. - 2002. - № 15(4). - С. 461-465. (doi: https://doi.org/10.5713/ajas.2002.461).
13. Asroush F. Genetic characterization of Markhoz goat breed using microsatellite markers / F. Asroush, S-Z. Mirhoseini N. Badbarin A. Seidavi V. Tufarelli V. Laudadio C. Dario M. Maria Selvaggi //Arch.Anim. Breed. - 2018. -№ 61. - P. 469-473. (doi.org/10.5194/aab-61-469-2018).
14. Lenstra J.A. Microsatellite diversity of the Nordic type of goats in relation to breed conservation: how relevant is pure ancestry? / J.A. Lenstra J. Tigchelaar I. Biebach, Econogene Consortiuma J.H. Hallsson J. Kantanen V.H. Nielsen F. Pompanon S. Naderi H.-R. Rezaei N. Ssther O. Ertugrul C. Grossen G. Camenisch M. Vos-Loohuis M. van Straten E.A. de Poel J. Windig K.J. Oldenbroek // Anim. Breed. Genet. - 2017. - № 134. - P. 78-84. (doi:10.1111/jbg.12226).
15. Петров С.Н. Разработка мультиплексной STR-панели для контроля достоверности происхождения и характеристики генетического разнообразия коз. / С.Н. Петров В.Р. Харзинова Е.А. Гладырь Ч.С. Самбу-Хоо Н.А. Зиновьева // Достижения науки и техники АПК. - 2018. - № 32, 11. - С. 60-63.
16. Peakall R. GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research - an update. / R. Peakall P.E. Smouse // Bioinformatics - 2012. -№ 28. - P. 2537-2539. (doi: 10.1093/bioinformatics/bts460).
17. Brown A.H.D. Measuring genetic variability in plant populations. In: Isozymes in plant genetics and breeding, Part A. / A.H.D. Brown B.S. Weir S.D. Tanksley T.J. Orton (eds.) // Amsterdam. - Elsevier Science Publ. - 1983.
18. Kalinowski S.T. Counting alleles with rarefaction: Private alleles and hierarchical sampling designs // Conserv. Genet. - 2004. - № 5. - P. 539-543. (doi: 10.1023/B: C0GE.0000041021.91777.1a).
19. Hartl D.L. Principles of population genetics / D.L. Hartl A.G. Clark // Massachusetts. - Sunderland. - 1997.
20. Keenan K. diveRsity: An R package for the estimation and exploration of population genetics parameters and their associated errors / K. Keenan P. McGinnity T.F. Cross W.W. Crozier P.A. Prodohl // Methods in Ecology and Evolution. - 2013. -№ 4. - P. 782-788. (doi.org/10.1111/2041-210X.12067).
21. Jost L. GST and its relatives do not measure differentiation // Mol. Ecol. - 2008. - № 17. - P. 4015-4026. (doi: 10.1111/j.1365-294X.2008.03887.x).
22. Nei M. Genetic distance between populations // Am. Nat. - 1972. - № 106 (949). - P. 283-292. (doi: 10.1086/282771).
23. Huson D.H. Application of phylogenetic networks in evolutionary studies / D.H. Huson D. Bryant // Molecular Biology and Evolution. - 2006. - № 23. - P. 254-267. (doi. org/10.1093/molbev/msj030).
24. Jombart T. adegenet: a R package for the multivariate analysis of genetic markers // Bioinformatics. - 2008. -№ 24. - P. 1403-1405. (doi: 10.1093/bioinformatics/btn129).
25. Wickham H. ggplot2: Elegant graphics for data analysis // NY - Springer-Verlag. - 2009.
26. R Core Team. R: a language and environment for statistical computing. R Foundation for statistical computing. Vienna. - Austria. - 2012. http://www.Rproject.org.
27. Seilsuth S. Microsatellite analysis of the genetic diversity and population structure in dairy goats in Thailand / S. Seilsuth J.H. Seo H.S. Kong G.J. Jeon // Asian-Australis J Anim Sci. - 2016. - № 29(3). - P. 327-332. (doi: 10.5713/ajas.15.0270).
28. Mahrous K.F. Genetic diversity in Egyptian and Saudi goat breeds using microsatellite markers / K.F. Mahrous S.Y.M. Alakilli L.M. Salem S.H. Abd El-Aziem A.A. El Hanafy // Journal of applied biosciences. - 2013. -№ 72. - P. 5838-5845. (doi: 10.4314/jab.v72i1.99671).
29. Patterson N. Population Structure and Eigenanalysis / N. Patterson A.L. Price D. Reich // PLoS Genet. - 2006. -№ 2(12). - e190. (doi.org/10.1371/journal.pgen.0020190).
30. Novembre J. Genes mirror geography within Europe / J. Novembre T. Johnson K. Biyc Z. Kutalik A.R. Boyko // Nature. - 2008. - № 456. - P. 98-101.
31. Храброва Л.А. Методические положения по использованию ДНК-анализа лошадей для оценки генетических ресурсов в коневодстве / Л.А. Храброва Л.В. Калинкова М.А. Зайцева. - Дивово. - 2011. - 28 c.
32. Maletsanake D. Genetic variation from 12 microsatellite makers in an indigenous Tswana goat flock in Southeastern Botswana / D. Maletsanake S.J. Nsoso P.M. Kgwatalala // Livestock research for rural development. - 2013. - № 25 (2).
33. Davila S.G. Evaluation of diversity between different Spanish chicken breeds, a tester line and White Leghorn population based on microsatellite markers / S.G. Davila M.G. Resino-Talavan J.L. Campo // Poult.Sci. - 2009. -№ 88. - P. 2518-2525. (doi: 10.3382/ps.2009-00347).
34. Doiji N. Genetic characterization of Bhutanese native chickens based on an analysis of Red Junglefowl (Gallus gallusgallus and Gallus gallusspadecieus), domestic Southeast Asian and commercial chicken lines (Gallus gallusdomesticus) / N. Dorji M. Duangjinda Y. Phasuk // Genetics and Molecular Biology. - 2012. - № 35. - P. 603-609 (doi: 10.1590/ S1415-47572012005000039).
35. Mahmoudi B. Breed characteristics in Iranian native goat populations / B. Mahmoudi M. Babayev Sh. Hayeri Khiavi F. Pourhosein M. Daliri // Journal of cell and animal biology. - 2011. - № 5(7). - P. 129-134.
36. Mekuriaw G. Review on current knowledge of genetic diversity of domestic goats (Capra hircus) identified by microsatellite loci: how those efforts are strong to support the breeding programs? / G. Mekuriaw S. Gizaw T. Dessie O. Mwai A. Djikeng K. A Tesfaye // Journal of Life Science and Biomedicine. - 2016. - № 6(2). - P. 22-32.
Review
For citations:
, , , , . Sheep, goats, wool business. 2019;(3):7-11. (In Russ.)
Views:
112
Email this article 