Анализ полиморфизмов, ассоциированных с копытной гнилью у домашних и диких представителей рода ovis
https://doi.org/10.26897/2074-0840-2024-3-46-50
Аннотация
В статье представлены результаты определения генотипов в трех целевых SNP в гене MPDZ – потенциальном кандидате, влияющем на устойчивость овец к копытной гнили, у представителей домашних и диких Ovis. В качестве материалов для исследования были использованы высокоплотные SNP-профили, сгенерированные для 15 локальных пород домашних овец и 4 диких видов рода Ovis. SNP-профили 10 иностранных пород были добавлены к выборке как группы сравнения. Определены мажорные и минорные аллели в целевых SNP (rs418747104, rs426927857, rs406749947). Дискутируется влияние специфических генотипов в целевых SNP на устойчивость к копытной гнили. Результаты нашего исследования – это одна из первых попыток к пониманию генетических механизмов, лежащих в основе устойчивости / восприимчивости к копытной гнили у пород домашних овец, разводимых в России, и диких представителей рода Ovis.
Ключевые слова
SNP,
генотипирование,
генетическая устойчивость,
генетическое разнообразие,
род Ovis,
копытная гниль
Об авторах
Т. Е. Денискова
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр животноводства – ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста»
Россия
Россия
Татьяна Евгеньевна Денискова, канд. биол. наук, доцент, вед. науч. сотрудник группы генетики и геномики мелкого рогатого скота
тел.: (916) 914-20-17
142132, Московская область, г.о. Подольск, пос. Дубровицы, д. 60
А. В. Доцев
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр животноводства – ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста»
Россия
Россия
Арсен Владимирович Доцев, канд. биол. наук, вед. науч. сотрудник, зав. лабораторией популяционной и эволюционной геномики животных
тел.: (915) 316-79-65
142132, Московская область, г.о. Подольск, пос. Дубровицы, д. 60
Список литературы
1. Mucha S., Bunger L., Conington J. Genome-wide association study of footrot in Texel sheep • Genetics, selection, evolution: GSE, 2015. No. 47 (1). P. 35. DOI: 10.1186/s12711-015-0119-3.
2. Zingg D. [et al.] Epidemiological and economic evaluation of alternative on-farm management scenarios for ovine footrot in Switzerland • Frontiers in Veterinary Science,2017. No. 4. P. 70. DOI: 10.3389/fvets.2017.00070.
3. Raadsma H.W., Dhungyel O.P. A review of footrot in sheep: new approaches for control of virulent foot-rot • Livestock Science, 2013. No. 156. Pp. 115-125. DOI: 10.1016/j.livsci.2013.06.011.
4. Niggeler A. [et al.] A genome-wide significant association on chromosome 2 for footrot resistance/susceptibility in Swiss White Alpine sheep • Animal genetics, 2017.No. 48 (6). Pp. 712-715. DOI: 10.1111/age.12614
5. Gaspar D. [et al.] Genome-wide association study identifies genetic variants underlying footrot in Portuguese Merino sheep • BMC genomics, 2024. No. 25 (1). P. 100.DOI: 10.1186/12864-023-09844-x.
6. Cinar M.U. [et al.] Genome-wide association with footrot in hair and wool sheep • Frontiers in genetics, 2024.No. 14. P. 1297444. DOI: 10.3389/fgene.2023.129744449
7. Igoshin A.V. [et al.] Copy number variants in genomes of local sheep breeds from Russia • Animal Genetics, 2022.No. 53 (1). Pp. 119-132. DOI: 10.1111/age.13163.
8. Dotsev A. [et al.] Genome-Wide Insights into Intraspecific Taxonomy and Genetic Diversity of Argali (Ovis ammon) • Diversity, 2023. No. 15 (5). P. 627. DOI: 10.3390/d15050627.
9. Денискова Т.Е. [и др.] Полиморфизм в генах-кандидатах, связанных с репродуктивными функциями у овец (Ovis spp.) • Сельскохозяйственная биология,2023.Nº 58(6).C.1046-1056.DOI: 10.15389/agrobiology.2023.6.1046rus.
10. Wimmershoff J.[et al.] Outbreak of severe foot rot associated with benign Dichelobacter nodosusin an Alpine ibex colony in the Swiss Prealps • Schweiz Arch Tierheilkd, 2015. No. 157 (5). P. 277-284. DOI: https://doi.org/10.17236/sat00021
11. Зиновкин И.А., Воронкова О.А. Сравнение степе-ни устойчивости пород овец чистых линий и их гибридов к копытной гнили и её лечение. Молодые исследователи агропромышленного и лесного комплексов - регионам. Том 3. Часть 2. Биологические науки: Сб. науч. трудов по результатам работы VIII Всероссийской научно-практ. конференции с международным участием • Вологда-Молочное: ФГБОУ ВО Вологодская ГМХА, 2023. 250 с.
12. Emery D.L., Stewart D.J., Clark B.L. The comparative susceptibility of five breeds of sheep to foot-rot • Australian Veterinary Journal, 1984. No. 61 (3). P. 85-88. DOI: 10.1111/j.1751-0813.1984.tb15524.x.
Рецензия
Для цитирования:
Денискова Т.Е., Доцев А.В. Анализ полиморфизмов, ассоциированных с копытной гнилью у домашних и диких представителей рода ovis. Овцы, козы, шерстяное дело. 2024;(3):46-50. https://doi.org/10.26897/2074-0840-2024-3-46-50
For citation:
Deniskova T.E., Dotsev A.V. Analysis of polymorphisms associated with footrot in domestic and wild representatives of the genus ovis. Sheep, goats, wool business. 2024;(3):46-50. (In Russ.) https://doi.org/10.26897/2074-0840-2024-3-46-50
Просмотров:
36
Послать статью по эл. почте 