woolОвцы, козы, шерстяное делоSheep, goats, wool business2074-0840РГАУ-МСХА10.26897/2074-0840-2024-3-46-50wool-397Research ArticleМОРФОЛОГИЯ, ФИЗИОЛОГИЯ, БИОХИМИЯMORPHOLOGY, PHYSIOLOGY, BIOCHEMISTRYАнализ полиморфизмов, ассоциированных с копытной гнилью у домашних и диких представителей рода ovisAnalysis of polymorphisms associated with footrot in domestic and wild representatives of the genus ovisДенисковаТ. Е.DeniskovaT. E.

Татьяна Евгеньевна Денискова, канд. биол. наук, доцент, вед. науч. сотрудник группы генетики и геномики мелкого рогатого скота

тел.: (916) 914-20-17

142132, Московская область, г.о. Подольск, пос. Дубровицы, д. 60

Tatyana E. Deniskova, Ph D. Biol. sciences, Associate Professor, Leading Researcher of the Group of Genetics and Genomics of small cattle

 tel.: (916) 914-20-17

60 Dubrovitsy village, Podolsk, Moscow region, 142132

horarka@yandex.ruДоцевА. В.DotsevA. V.

Арсен Владимирович Доцев, канд. биол. наук, вед. науч. сотрудник, зав. лабораторией популяционной и эволюционной геномики животных

тел.: (915) 316-79-65

142132, Московская область, г.о. Подольск, пос. Дубровицы, д. 60

Arsen V. Dotsev, Ph D. Biol. sciences, Leading Researcher, Head of the Laboratory of Population and Evolutionary Genomics of Animals

 tel.: (915) 316-79-65

60 Dubrovitsy village, Podolsk, Moscow region, 142132

asnd@mail.ruФедеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр животноводства – ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста»РоссияFederal State Budgetary Scientific Institution “Federal Research Center of Animal Husbandry – VIZ named after Academician L.K. Ernst”Russian Federation202409102024034650Copyright © Денискова Т.Е., Доцев А.В., 20242024Денискова Т.Е., Доцев А.В.Deniskova T.E., Dotsev A.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://wool.timacad.ru/jour/article/view/397

В статье представлены результаты определения генотипов в трех целевых SNP в гене MPDZ – потенциальном кандидате, влияющем на устойчивость овец к копытной гнили, у представителей домашних и диких Ovis. В качестве материалов для исследования были использованы высокоплотные SNP-профили, сгенерированные для 15 локальных пород домашних овец и 4 диких видов рода Ovis. SNP-профили 10 иностранных пород были добавлены к выборке как группы сравнения. Определены мажорные и минорные аллели в целевых SNP (rs418747104, rs426927857, rs406749947). Дискутируется влияние специфических генотипов в целевых SNP на устойчивость к копытной гнили. Результаты нашего исследования – это одна из первых попыток к пониманию генетических механизмов, лежащих в основе устойчивости / восприимчивости к копытной гнили у пород домашних овец, разводимых в России, и диких представителей рода Ovis.

The article presents the results of genotype determination in three target SNPs in the MPDZ gene, a potential candidate influencing the resistance of sheep to footrot, in representatives of domestic and wild Ovis. High-density SNP profiles generated for 15 local sheep breeds and 4 wild species of the genus Ovis were used as materials for the study. SNP profiles of 10 foreign breeds were added to the sample as comparison groups. Major and minor alleles in target SNPs (rs418747104, rs426927857, rs406749947) were determined. The influence of specific genotypes in target SNPs on resistance to footrot is discussed. In this study, we made the first attempt to understand the genetic mechanisms underlying resistance/susceptibility to footrot in domestic sheep breeds raised in Russia and wild representatives of the genus Ovis.

SNPгенотипированиегенетическая устойчивостьгенетическое разнообразиерод Ovisкопытная гнильSNPgenotypinggenetic resistancegenetic diversitygenus OvisfootrotReferencesMucha S., Bunger L., Conington J. Genome-wide association study of footrot in Texel sheep • Genetics, selection, evolution: GSE, 2015. No. 47 (1). P. 35. DOI: 10.1186/s12711-015-0119-3.Mucha S., Bunger L., Conington J. Genome-wideassociation study of footrot in Texel sheep • Genetics, se-lection, evolution: GSE, 2015. No. 47 (1). P. 35. DOI:10.1186/s12711-015-0119-3.Zingg D. [et al.] Epidemiological and economic evaluation of alternative on-farm management scenarios for ovine footrot in Switzerland • Frontiers in Veterinary Science,2017. No. 4. P. 70. DOI: 10.3389/fvets.2017.00070.Zingg D. [et al.] Epidemiological and economic evalu-ation of alternative on-farm management scenarios for ovinefootrot in Switzerland • Frontiers in Veterinary Science,2017. No. 4. P. 70. DOI: 10.3389/fvets.2017.00070.Raadsma H.W., Dhungyel O.P. A review of footrot in sheep: new approaches for control of virulent foot-rot • Livestock Science, 2013. No. 156. Pp. 115-125. DOI: 10.1016/j.livsci.2013.06.011.Raadsma H.W., Dhungyel O.P. A review of foot-rot in sheep: new approaches for control of virulent foot-rot • Livestock Science, 2013. No. 156. Pp. 115-125. DOI:10.1016/j.livsci.2013.06.011.Niggeler A. [et al.] A genome-wide significant association on chromosome 2 for footrot resistance/susceptibility in Swiss White Alpine sheep • Animal genetics, 2017.No. 48 (6). Pp. 712-715. DOI: 10.1111/age.12614Niggeler A. [et al.] A genome-wide significant asso-ciation on chromosome 2 for footrot resistance/susceptibil-ity in Swiss White Alpine sheep • Animal genetics, 2017.No. 48 (6). Pp. 712-715. DOI:10.1111/age.12614Gaspar D. [et al.] Genome-wide association study identifies genetic variants underlying footrot in Portuguese Merino sheep • BMC genomics, 2024. No. 25 (1). P. 100.DOI: 10.1186/12864-023-09844-x.Gaspar D. [et al.] Genome-wide association studyidentifies genetic variants underlying footrot in PortugueseMerino sheep • BMC genomics, 2024. No. 25 (1). P. 100.DOI: 10.1186/12864-023-09844-x.Cinar M.U. [et al.] Genome-wide association with footrot in hair and wool sheep • Frontiers in genetics, 2024.No. 14. P. 1297444. DOI: 10.3389/fgene.2023.129744449Cinar M.U. [et al.] Genome-wide association withfootrot in hair and wool sheep • Frontiers in genetics, 2024.No. 14. P. 1297444. DOI:10.3389/fgene.2023.129744449Igoshin A.V. [et al.] Copy number variants in genomes of local sheep breeds from Russia • Animal Genetics, 2022.No. 53 (1). Pp. 119-132. DOI: 10.1111/age.13163.Igoshin A.V. [et al.] Copy number variants in genomesof local sheep breeds from Russia • Animal Genetics, 2022.No. 53 (1). Pp. 119-132. DOI: 10.1111/age.13163.Dotsev A. [et al.] Genome-Wide Insights into Intraspecific Taxonomy and Genetic Diversity of Argali (Ovis ammon) • Diversity, 2023. No. 15 (5). P. 627. DOI: 10.3390/d15050627.Dotsev A. [et al.] Genome-Wide Insights into In-traspecific Taxonomy and Genetic Diversity of Argali(Ovis ammon) • Diversity, 2023. No. 15 (5). P. 627. DOI:10.3390/d15050627.Денискова Т.Е. [и др.] Полиморфизм в генах-кандидатах, связанных с репродуктивными функциями у овец (Ovis spp.) • Сельскохозяйственная биология,2023.Nº 58(6).C.1046-1056.DOI: 10.15389/agrobiology.2023.6.1046rus.Deniskova T.E. [et al.] Analysis of polymorphismin the major genes for reproductive traits in sheep (Ovis spp.)• Agricultural Biology, 2023. No. 58 (6). P. 1046-1056. DOI:10.15389/agrobiology.2023.6.1046eng.Wimmershoff J.[et al.] Outbreak of severe foot rot associated with benign Dichelobacter nodosusin an Alpine ibex colony in the Swiss Prealps • Schweiz Arch Tierheilkd, 2015. No. 157 (5). P. 277-284. DOI: https://doi.org/10.17236/sat00021Wimmershoff J.[etal.] Outbreak of severefoot rot associated with benign Dichelobacter nodosusin an Alpine ibex colony in the Swiss Prealps • SchweizArch Tierheilkd, 2015. No. 157 (5). P. 277-284. DOI:https://doi.org/10.17236/sat00021Зиновкин И.А., Воронкова О.А. Сравнение степе-ни устойчивости пород овец чистых линий и их гибридов к копытной гнили и её лечение. Молодые исследователи агропромышленного и лесного комплексов - регионам. Том 3. Часть 2. Биологические науки: Сб. науч. трудов по результатам работы VIII Всероссийской научно-практ. конференции с международным участием • Вологда-Молочное: ФГБОУ ВО Вологодская ГМХА, 2023. 250 с.Zinovkin I.A., Voronkova O.A. Comparison of the degreeof resistance of pure line sheep breeds and their hybrids to footrot and its treatment. Young researchers of agro-industrialand forestry complexes - to the regions. Vol. 3. Part 2. Biolog-ical sciences: Collection of scientific papers based on the re-sults of the VIII All-Russian Scientific and Practical Confer-ence with international participation • Vologda-Molochnoye:Federal State Budgetary Educational Institution of HigherEducation Vologda GMHA, 2023. 250 p.Emery D.L., Stewart D.J., Clark B.L. The comparative susceptibility of five breeds of sheep to foot-rot • Australian Veterinary Journal, 1984. No. 61 (3). P. 85-88. DOI: 10.1111/j.1751-0813.1984.tb15524.x.Emery D.L., Stewart D.J., Clark B.L. The compara-tive susceptibility of five breeds of sheep to foot-rot • Aus-tralian Veterinary Journal, 1984. No. 61 (3). P. 85-88. DOI:10.1111/j.1751-0813.1984.tb15524.x.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.