woolОвцы, козы, шерстяное делоSheep, goats, wool business2074-0840РГАУ-МСХА10.26897/2074-0840-2022-4-8-11wool-199Research ArticleРАЗВЕДЕНИЕ, СЕЛЕКЦИЯ, ГЕНЕТИКАBREEDING, SELECTION, GENETICSФилогенетический анализ полных последовательностей митохондриального генома овец куйбышевской породыPhylogenetic analysis of complete mitochondrial genomes of sheep of the Kuibyshev breedКошкинаО. А.KoshkinaO. A.

Кошкина Ольга Андреевна, аспирант, мл. науч. сотрудник группы генетики и геномики мелкого рогатого скота

тел.: (926) 532-21-19

olechka1808@list.ruДенисковаТ. Е.DeniskovaT. E.

Денискова Татьяна Евгеньевна, канд. биол. наук, доцент, вед. науч. сотрудник группы генетики и геномики мелкого рогатого скота

тел.: (916) 914-20-17

horarka@yandex.ruЗиновьеваН. А.ZinovievaN. A.

Зиновьева Наталия Анатольевна, доктор биол. наук, профессор, академик РАН, директор

тел.: (4967) 65-11-63

priemnaya-vij@mail.ruФедеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр животно водства – ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста»РоссияFederal State Budgetary Scientific Institution “Federal Research Center of Animal Husbandry – VIZ named after Academician L.K. Ernst”Russian Federation20221009202404811Copyright © Кошкина О.А., Денискова Т.Е., Зиновьева Н.А., 20242024Кошкина О.А., Денискова Т.Е., Зиновьева Н.А.Koshkina O.A., Deniskova T.E., Zinovieva N.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://wool.timacad.ru/jour/article/view/199

статье представлены результаты филогенетического анализа овец куйбышевской породы. Впервые получены и проанализированы в аспекте отдельных маркеров полные последовательности митохондриального генома российской породы овец. Установлен уровень полиморфизма в отдельных митохондриальных маркерах. Рассчитаны показатели генетического разнообразия как для отдельных генов, так и для полного митохондриального генома. На основании провденного анализа построено филогенетическое дерево, а также определена гаплогрупповая принадлежность изучаемых овец. Регулярное проведение подобных работ поспособствует накоплению знаний о полиморфизмах всех митохондриальных маркеров. Полученные знания позволят углубить понимание роли митохондриальной ДНК в жизнедеятельности овец.

Here, we present the results of a phylogenetic analysis of sheep of the Kuibyshev breed. Complete mitochondrial genome sequences of Russian sheep breed were obtained and then analyzed considering separate mitochondrial markers. The level of polymorphism in separate mitochondrial markers was established. Genetic diversity indicators were calculated for separate mitochondrial genes and for the complete mitochondrial genome. Based on the analysis, a phylogenetic tree was constructed, and the haplogroup assignment of the studied sheep was determined. Regular genetic monitoring will contribute to the accumulation of knowledge on the polymorphisms of all mitochondrial markers. Our study resulted in gaining new knowledge, which deepen the understanding of the role of mitochondrial DNA in the life functions support of sheep.

куйбышевская порода овецмитохондриальная ДНКгаплотипыгаплогруппыфилогенияKuibyshev sheep breedmitochondrial DNAhaplotypeshaplogroupsphylogenyReferencesПушкарев М.Г. Состояние породного овцеводства и козоводства России // Научные разработки и инновации в решении стратегических задач агропромышленного комплекса: Материалы Международной научно-практ. конференции. В 2-х томах, Ижевск, 15-18 февраля 2022 года. – Ижевск: Ижевская государственная сельскохозяйственная академия, 2022. – С. 85-87.Pushkarev M.G. The state of pedigree sheep and goat breeding in Russia // Scientific developments and innovations in solving strategic tasks of the agro-industrial complex: Materials of the International scientific and practical conference. In 2 volumes, Izhevsk, February 15-18, 2022. – Izhevsk: Izhevsk State Agricultural Academy, 2022. – Рp. 85-87.Лушников В.П. Полиморфизм гена CAST у овец татарстанской и эдильбаевской пород / В.П. Лушников, Т.О. Фетисова, А.А. Стрильчук // Овцы, козы, шерстяное дело. – 2020. – № 2. – С. 9-11.Lushnikov V.P. Polymorphism of the cast gene in sheep of Tatarstan and Edilbaevsky breeds / V.P. Lushnikov, T.O. Fetisova, A.A. Strilchuk // Sheep, goats, wool business. – 2020. – No. 2. – Рp. 9-11.Abecia J.A. Ewes giving birth to female lambs produce more milk than ewes giving birth to male lambs / J.A. Abecia, C. Palacios // Italian Journal of Animal Science. 2018; 17(3):736-739. doi: 10.1080/1828051X.2017. 1415705.Abecia J.A. Ewes giving birth to female lambs produce more milk than ewes giving birth to male lambs / J.A. Abecia, C. Palacios // Italian Journal of Animal Science. 2018; 17(3):736-739. doi: 10.1080/1828051X.2017. 1415705.Golik T.V. Spectra of ISSR-PCR Markers in Assessments of the Intrinsic Genetic Diff erentiation of the Karachai Horse / T.V. Golik, I.I. Gaponova, E.A. Knyaseva, T.A. Erkenov, T.T. Glazko. // Biogeosystem Technique. 2017; 4 (1): 9-24. DOI: 10.13187/bgt.2017.1.9.Golik T.V. Spectra of ISSR-PCR Markers in Assessments of the Intrinsic Genetic Differentiation of the Karachai Horse / T.V. Golik, I.I. Gaponova, E.A. Knyaseva, T.A. Erkenov, T.T. Glazko. // Biogeosystem Technique. 2017; 4 (1): 9-24. DOI: 10.13187/bgt.2017.1.9.Glazko V.I. Genetic Structure of Karachai Horses on ISSR-PCR Markers / V.I. Glazko, T.A. Erkenov, T.T. Glazko, K.M. Dzatoev // Biogeosystem Technique. 2016; 9(3):195-204. DOI: 10.13187/bgt.2016.9.195.Glazko V.I. Genetic Structure of Karachai Horses on ISSR-PCR Markers / V.I. Glazko, T.A. Erkenov, T.T. Glazko, K.M. Dzatoev // Biogeosystem Technique. 2016; 9(3):195-204. DOI: 10.13187/bgt.2016.9.195.Денискова Т.Е. Оценка биоразнообразия у межвидовых гибридов рода Ovis с использованием STR- и SNP-маркеров / Т.Е. Денискова, А.В. Доцев, В.А. Багиров [и др.] // Сельскохозяйственная биология. – 2017. – № 52 (2). – С. 251-260. – DOI 10.15389/agrobiology.2017.2.251rus.Deniskova T.E. Assessment of biodiversity in interspecific hybrids of the genus “Ovis” using SPO and SnP markers / T.E. Deniskova, A.V. Dotsev, V.A. Bagirov [et al.] // Agricultural biology. – 2017. – № 52 (2). – Pp. 251-260. – DOI 10.15389/agrobiology.2017.2.251rus.Meadows J.R. Five ovine mitochondrial lineages identifi ed from sheep breeds of the near East / J.R. Meadows, I. Cemal, O. Karaca, E. Gootwine, J.W. Kijas // Genetics. 2007; 175(3): 1371-1379 doi: 10.1534/ge-netics.106.068353.Meadows J.R. Five ovine mitochondrial lineages identified from sheep breeds of the near East / J.R. Meadows, I. Cemal, O. Karaca, E. Gootwine, J.W. Kijas // Genetics. 2007; 175(3): 1371-1379 doi: 10.1534/ge-netics.106.068353.Кошкина О.А. Оценка материнской изменчивости российских локальных пород овец на основе анализа полиморфизма гена цитохрома b / О.А. Кошкина, Т.Е. Денискова, А.В. Доцев [и др.] // Сельскохозяйственная биология. – 2021. – № 56 (6). – С. 1134-1147. – DOI 10.15389/agrobiology.2021.6.1134rus.Koshkina O.A. Assessment of maternal variability of Russian local sheep breeds based on the analysis of cytochrome b gene polymorphism / O.A. Koshkina, T.E. Deniskova, A.V. Dotsev [et al.] // Agricultural Biology. – 2021. – № 56 (6). – Pp. 1134-1147. – DOI 10.15389/agrobiology.2021.6.1134rus.Barbato M. Islands as time capsules for genetic diversity conservation: the case of the giglio island moufl on / M. Barbato, M. Masseti, M. Pirastru, N. Columbano, M. Scali, R. Vignani, P. Mereu, // Diversity. 2022; 14(8): 609.Barbato M. Islands as time capsules for genetic diversity conservation: the case of the giglio island mouflon / M. Barbato, M. Masseti, M. Pirastru, N. Columbano, M. Scali, R. Vignani, P. Mereu, // Diversity. 2022; 14(8): 609.Liu J. Phylogeography and phylogenetic evolution in Tibetan sheep based on MT-CYB sequences / J. Liu, Z. Lu, C. Yuan, F. Wang, B. Yang // Animals. 2020; 10(7): 117 (doi: 10.3390/ani10071177).Liu J. Phylogeography and phylogenetic evolution in Tibetan sheep based on MT-CYB sequences / J. Liu, Z. Lu, C. Yuan, F. Wang, B. Yang // Animals. 2020; 10(7): 117 (doi: 10.3390/ani10071177).Yu L. Mitogenomic analysis of Chinese snub-nosed monkeys: Evidence of positive selection in NADH dehydrogenase genes in highaltitude adaptation / L. Yu, X. Wang, N. Ting, Y. Zhang // Mitochondrion. 2011; 11(3): 497-503. https://doi.org/10.1186/s12862-017-0896-0.Yu L. Mitogenomic analysis of Chinese snub-nosed monkeys: Evidence of positive selection in NADH dehydrogenase genes in highaltitude adaptation / L. Yu, X. Wang, N. Ting, Y. Zhang // Mitochondrion. 2011; 11(3): 497-503. https://doi.org/10.1186/s12862-017-0896-0.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.